真空冷卻干燥機主要目的就是用來除去壓縮空氣中的水分的，用冷干機能除去90%以上的飽和水蒸汽，如果冷干機后部管路仍有大量水分，那就需要對真空冷卻干燥機進行檢查。實際上，還有以下幾種原因會造成除水效果不良：
  
  壓縮空氣管路旁通閥門沒有關閉、真空冷卻干燥機內部前置換熱器內漏、排水器不良。這時只需要將真空冷卻干燥機關緊就可以了。如果冷干機內部換熱器泄露，這會造成一部分壓縮空氣不經過蒸發器直接從冷干機出氣口出去，這問題幾乎無法處理，一般直接換臺機器。當然選擇有規模的正規企業產品就會減少碰到這種問題的幾率。
  
  排水器雖是真空冷卻干燥機內的一個易損小部件，但也是一個很重要的地方。真空冷卻干燥機要除水必須通過排水器排出機外，如果排水器堵塞或損壞不能正常排水，那冷干機就失去了除水功能，壓縮空氣中的水分會原封不動跑到后部管路。
  
  所以碰到除水效果不佳的情況，就應仔細檢查排水器工作狀況。日常維護工作除了適時清洗冷凝器，另外就是經常檢查排水器工作情況，一有堵塞現象應及時清洗。具體清洗辦法是這樣，如果是輕微堵塞，可以往排水器內倒入少許洗潔精，然后上下晃蕩幾次再洗凈即可。